Renta 2007: venta de un porcentaje de la vivienda (no el 100%)

Hola,
el año pasado vendí un porcentaje de la vivienda habitual a mi mujer (estamos casados en régimen de separación de bienes), yo me quedé con el 88% (antes era 100% mía) y ella con el 12%. Tengo algunas dudas a la hora de hacer la declaración de la renta con el programa PADRE:
- en el apartado donde habría que poner la venta de la vivienda (ganancias y pérdidas patrimoniales), parece que sólo está contemplado el caso en que se vende el 100% de la vivienda, ya que no hay manera de indicar un porcentaje. ¿Debería poner los datos proporcionales calculando yo los porcentajes?
- también se pide especificar el total de gastos de la operación. Como vendedor, ¿qué gastos debo incluir? ¿el impuesto de plusvalía? ¿los gastos de escrituración, o esto lo paga el comprador?
- el 12% de lo que me costó la vivienda en el año 2000 son 15700 euros aprox., para la venta lo redondeamos a 16000 euros (es lo que tenía mi mujer en su cuenta vivienda). No quería obtener beneficios con esta venta, simplemente venderle una parte por lo que me costó. El impuesto de plusvalía se calculó con este incremento. Pero el programa PADRE hace una "corrección" del precio de compra y dice que el equivalente de esos 15700 euros ahora serían unos 18000, por lo que realmente he tenido una "pérdida patrimonial". ¿Hay algún problema por esto, o pueden reclamarme que he hecho la venta por debajo del precio de mercado? Con lo que se han hinchado los precios de los pisos estos 7 años...

Un saludo.