Pago de impuestos por venta de vivienda

Hola,mirando en el foro no he encontrado nada parecido por lo que abro un tema nuevo.

Vamos a vender nuestra única vivienda, de la cual hace un par de años hemos ampliado la hipoteca, para comprar un coche y hacer una reforma en la vivienda.

La pregunta es, a la hora de pagar impuestos (entendemos que son 18% de la ganancia entre precio de escritura de compra y precio de escritura de venta),¿tienen en cuenta la cantidad que queda en la hipoteca la cual es mas alta del precio de compra por escritura? Entonces no vamos a tener casi ningún beneficio.

Ademas, nos vamos a vivir en el extranjero ¿Como pagamos dicho impuesto si tienes dos años para pagarlo?

Gracias por la ayuda.