compra de coche a una empresa

Hola, a ver si me podéis ayudar.

Soy de Andalucía y hace unos 10 años compré un coche a nombre de la empresa de mi jefe poque me beneficiaba con un descuento. La sociedad de mi jefe se dedica a la compra de viviendas en subastas y está exenta de IVA.

Ahora quiero ponerlo a mi nombre pero no sé cómo afectará fiscalmente esto a mi jefe. Al principio íbamos a hacer una compraventa y pagar el ITP que es un 4% del valor (121 €) pero después nos han dicho que mi jefe tiene que hacerme una factura y con ello voy a DGT.

Mi pregunta es: si me hace una factura con iva, ¿ese iva le perjudica fiscalmente a la empresa?

El dice que el IVA de la compra no lo puedo declarar porque la empresa está exenta de iva, pero creo que durante estos años ha estado metiéndolo en la declaración.

Es que si tengo que pagarle el iva no me interesa porque entonces tendré que pagar mucho más que con el ITP.

Cómo se podría hacer el cambio de nombre del vehículo de manera que el soporte fiscal sea el menor posible para las dos partes.

Gracias