PROBLEMAS CON EL IVA

Hola a tod@s,

Tengo un problemas y es el siguiente pues es la primera vez que me encuentro con algo así. Este mes ya cuando estoy terminando de cerrar el cuarto trimestre de iva, me han traido unas facturas de una cooperativa con la que trabajamos, en estas facturas el iva/compensación viene a un 10%.. (tengo que decir que le ampresa en la que trabajo se dedica a la agricultura)

No habría ningun problema en principio pero en enero de 2010 pasó la empresa al Regimen General de Iva. En las facturas de otra cooperativa con las que trabajamos, el IVA éstá correctamente un 4% pero en está en concreto no puesto que no realizaron el cambio.

La cuestión es que son facturas de todo un año.. no sólo hay de este ultimo trimestre. Yo claro iba a presentar unas complementarias cuando las recibí pero al ver esto no sé como proceder.

¿Alguién podría asesorarme?

Gracias.