Cómo solicitar devolución de ingresos indebidos?

Que documento oformulario debería emplear para lo siguiente, solicitar la devolución del iva dejado de deducir por aplicación de la regla de prorrata durante los ejercicios 2002,2003 y 2004, esta aplicación de la regla deprorrata la hicimos por recibir subvenciones, y con la sentencia del TJCE, no deberíamos haber aplicado dicha prorrata, por lo que deberiamos solicitar ahora esto porque el año 2002, ¿ prescribe ahora no?. No se como hemos de solicitar dicha devolución