Trámite de entrega de dinero en el momento de firma de escrituras

Hola, en breve tengo que firmar las escrituras de mi piso y de la hipoteca. Me gustaría saber cómo es el trámite de entrega de dinero en el momento de firma de escrituras. Tengo una cuenta vivienda en una entidad distinta a la que me da la hipoteca ¿se pueden pagar los gastos de la escritura directamente llevando yo la cuenta vivienda o debo entregar primero la cantidad a la entidad que me da la hipoteca para que ellos gestionen todos los pagos en el notario? Me da miedo que Hacienda diga que al pasar la cuenta vivienda y el dinero otra cuenta de otra entidad a la misma cuenta de la entidad que me gestiona la hipoteca no se conserven las deducciones por cuenta vivienda, ¿como se debe hacer este trámite? Gracias.